Основание древнего Ильинского храма можно отнести к ранней истории Ярославля, а первое известное письменное
упоминание о нём содержится в документальном источнике второй половины XVI века. В документе говорится о чуде исцеления
прихожанки Ильинской церкви: "В лето 7085 (1577) мая в 8 день у тех же гробов Бог простил Ларионову жену Еуфимию, тёмну оком,
от Ильи Пророка с Пробойной улицы".
В 1620 году по заказу прихожан Ильинской церкви был составлен рукописный сборник, в который, в частности, вошла
неизвестная ранее редакция жития ярославских святых князей Фёдора, Давида и Константина. На одной из страниц рукописи имеется
запись о том, что книга создана "рукою многогрешного раба Божия Георгия Евсевиева сына Комынина в преславном и в преименитом
и в богоспасаемом граде Ярославле, по велению ярославцов посадских людей Ивана да Козмы, да Назария, да Аникия Второво
сына Чистово и иных посадских людей, святого и славного Ильи прихожан, и совершена быть сия книга в лето 7128 (1620) года
марта в 23 день... И положена бысть в храм святого Пророка Илии и преподобного отца Варлаама Хутынского Чудотворца, а настоящий
храм Покрова Пресвятой Богородицы на Пробойной улице в граде Ярославле Повольском". Как видно из записи в житийном сборнике,
приходский ансамбль состоял из двух деревянных храмов: летнего - Ильи Пророка с приделом Варлаама Хутынского и зимнего - Покрова
Богородицы.
Строительство каменной церкви Ильи Пророка было начато 9 мая 1647 года, а освящение состоялось 16 июня 1650 года
ростовским митрополитом Варлаамом. Строительство велось на средства богатейших местных купцов братьев Вонифатия и Иоанникия
Скрипиных, которые нажили капиталы на торговле пушниной.
Скрипины, как и их предшественники (Надея Светешников, Гурьевы), устроили в возведённом ими храме домовую церковь
- в северном приделе, посвятив её покровителям домашнего очага Гурию, Самону и Авиву. В подклете придела находится усыпальница,
где погребены храмоздатели Скрипины и их потомки, в ней восемь захоронений. В 1680 году была выполнена роспись алтарной части
усыпальницы.

Усыпальница Скрипиных. 2000 год