В октябре 1918 года прихожанами Петропавловского храма было подано два прошения в Комиссариат по церковным и монастырским имуществам Ярославля
и Ярославского уезда с просьбой не применять постановление об освобождении помещений из-под домовых церквей при учебных заведениях к Петропавловской
церкви, «так как последняя не является домовой церковью, находясь не в школьном и не при школе состоящем, а в своем собственном, специально для храма
выстроенном, помещении, и представляла и представляет из себя не церковь при учебном заведении, а церковь приходскую, в прежнее время таковую
по-преимуществу, а ныне–исключительно».
В марте 1919 года командир Ярославского Отдельного Караульного Батальона сообщал в Отдел по учёту Церковно-монастырского имущества, что
«для совершения богослужения в церкви Петра и Павла, что при кадетском корпусе с моей стороны препятствий не встречается». Ярославской Губернской Комиссии
по церковно-монастырским делам причту и группе верующих граждан прихода церкви Петра и Павла был выдан мандат в том, что «согласно декрета «об отделении
церкви от Государства» и заключении договора, на основании ходатайства верующих граждан, железнодорожных служащих, и уведомление Ярославского Отделения
Караульного Батальона к открытию означенной церкви со стороны Комиссии препятствия нет».