Николаевский детский приют создавался в период, когда Ярославская Большая мануфактура меняла владельца и много фабричных было выброшено на улицу. Почти у всех – дети. И тогда некто Алексей Иванович Трунов, купец,
торговавший алмазами, решил открыть для них приют. Купил этот дом у ярославского купца А. А. Голкина за 5650 рублей, соответствующим образом его переделал и оборудовал. Потом дела у него пошли неудачно, и он обратился за помощью в
городскую думу. Принять на себя необходимые расходы бюджет города не смог, но дума нашла другого благодетеля – купца А. Д. Топленинова. Тот взял приют на своё обеспечение. В том же здании открыл банк, определённый процент
от прибыли которого пошёл на содержание приюта. Когда он умер, попечителем стал Леонид Николаевич Пастухов, сын всем известного Николая Петровича Пастухова, основателя знаменитого Пастуховского училища.
В здании приюта по воле А. И. Трунова его наследники устроили домовую церковь в честь Живоначальной Троицы, которая была освящена 24 мая 1862 года архиепископом Нилом. Располагалась она в правой части здания по улице
Наумова (ранее - ул. Подгорная). Круглая апсида - это только алтарь. В советское время помещение церкви сделали двухэтажным. Клирос (место для хора) располагалось вверху, рядом со звонницей. (И сейчас над входом в здание имеется
проем на крыше - место для колокола).

Интерьер Троицкой церкви при Николаевском приюте на Московской улице