Трагические события, происходившие в Ярославле летом 1918 года, нанесли столь тяжёлый урон Пятницкой церкви, что это сказалось на судьбе храма в будущем. От обстрела этого района города пушками красных
бронепоездов в стенах холодной церкви были пробиты большие бреши, частично снесена кровля. Пятницкий приход по решению городских властей был ликвидирован в 1931 году, холодная церковь и колокольня разобраны в 1937 году.
Сохранившаяся тёплая церковь Параскевы Пятницы в 1995 году возвращена Церкви. В ходе восстановительных работ открылись настенные росписи, их отреставрировали и частично поновили ярославские мастера во
главе с Е. А. Чижовым и С. В. Крыловым. Центральный иконостас выполнен архангелогородским резчиком Валерием Михайловичем Сорокиным и ярославским художником Сергеем Томилиным.
В 1997 году в храм была вложена старинная икона Николая Чудотворца, дарители, пожилые супруги, пожелали остаться безымянными.